.png){kind=spacer}
GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS | Kredi |
|---|---|---|---|---|---|---|
| EGEN310 | Sistem Biyolojisi | Seçmeli Ders Grubu | 3 | 6 | 5.00 | 3.00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Dersin Amacı
Dersin amacı bitki gelişim biyolojisi ve farklılaşmayı etkileyen iç ve dış faktörlerin anlaşılmasıdır.
Dersi Veren Öğretim GörevlisiGörevlileri
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Öğrenciler farklılaşma sırasında genleri etkileyen hücre dışı faktörler hakkında bilgi sahibi olacaktırlar. |
Öğrenim Türü
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Gelişim biyolojisinin tanımı, gametogenesis ve fertilizasyon, gelişimin safhaları, bölünme, morfogenez, farklılaşma mekanizmaları, farklılaşmada genetik faktörlerin ve sitoplazmanın rolü, farklılaşma sırasında genleri etkileyen hücre dışı faktörler, embriyonun beslenmesi, organ oluşumu sırasında hücreler arası etkileşimler konuları işlenecektir.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | [OgretimYontemVeTeknikleri] | [OnHazirlik] |
|---|---|---|---|
| 1 | Sistem biyolojisinin temelleri : Temel kavramlar- DNA (kromozom, gen, gen yazılımı kavramları), protein sentezi ve katlanması olayları | ||
| 2 | Hücredeki yolizlerine genel bakış : Metabolik tepkime ağları, Sinyal ileti ağları, Gen-kontrol ağları | ||
| 3 | Hücresel ağyapılar ve Çizge Kuramı | ||
| 4 | Genom bilimlerindeki deneysel teknikler : Transkriptom verilerini ölçmede kullanılan DNA çipleri, Proteom, İnteraktom, Metabolom, ve Flaksom verilerini deneysel ölçme yöntemleri | ||
| 5 | MATLAB'da programlama ve istatistik hesaplamaları: biyolojik verilerin analizine uygulamaları | ||
| 6 | İstatistiksel anlam testleri: Parametrik ve parametrik-olmayan anlam testleri (t-test, u-test, ANOVA) | ||
| 7 | İstatistiksel anlam testleri: Gene Expression Omnibus (GEO) veritabanının MATLAB ile kullanımı, Gen Ontolojisi (GO) Analizi | ||
| 8 | Ara Sınav | ||
| 9 | Benzerlik testleri: Parametrik ve parametrik-olmayan benzerlik testleri, Kümeleme yöntemleri | ||
| 10 | Yönlendirmesiz boyut küçültme teknikleri: Temel Bileşenler Analizi, Bağımsız Bileşenler Analizi | ||
| 11 | Yönlendirmeli boyut küçültme teknikleri: Fisher Discriminant Analizi, Destek Vektör Makineleri | ||
| 12 | Hücre metabolizması ve modelleme teknikleri: Metabolik akıların hesaplanmasında Akı Dengesi Analizi (FBA) yöntemi, Optimizasyon ve Doğrusal Programlamanın Temelleri | ||
| 13 | Hücre metabolizması ve modelleme teknikleri: FBA, Akı Değişkenliği Analizi (FVA), Genom ölçekli metabolik modeller, Karesel programlama (Metabolik Ayarlamanın Minimumu Analizi, MOMA) | ||
| 14 | Sistem Biyolojisinin hücre metabolismasına uygulama örnekleri ve hücre sinyal ileti mekanizmalarına uygulama örnekleri | ||
| 15 | Final Dönemi ve Genel Değerlendirme |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 3 | 3 |
| Final Sınavı | 1 | 3 | 3 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 30 | 30 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 30 | 30 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 128 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 4 | 3 | 1 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek